ONE GENE-ONE POLYPEPTIDE

Review on : Hipotesis Satu Gen Satu Polipeptida
Oleh: Prof. Dr. Duran Corebima A., M. Pd

Tahun 1902, Archibald E. Garrod menyatakan mengusulkan "Kesalahan bawaan Metabolisme" dalam kaitannya dengan kelainan fisiologis secara turun-temurun di antara manusia sejak saat itu lebih jelas diketahui bahwa ada hubungan antara gen dan enzim, bahkan cara untuk memecahkan masalah bagaimana gen mengendalikan sifat fenotip dari suatu organisme. Penelitian genetik kemudian berkaitan dengan hubungan antara gen dan enzim menemukan suatu konsep "hipotesis satu gen satu enzim" setelah itu direvisi menjadi "hipotesis satu gen satu polipeptida".
Peninjauan ini dilakukan dalam rangka untuk membantu kita mengevaluasi ulang konsep hipotesis satu gen satu polipeptida. Apakah persepsi kita atau pemahaman hari ini sudah mempertimbangkan berbagai aspek lain yang terkait? Apakah saat ini persepsi kita terbentuk tanpa banyak pertimbangan dengan tepat?

Hipotesis Satu Gene Satu Enzim
Seperti dinyatakan sebelumnya, hubungan antara gen dan enzim telah ditemukan sejak publikasi Archibald E. Garrod. Salah satu kelainan beberapa manusia dilaporkan oleh A.E Garrod yang secara bersamaan mengindikasikan hubungan antara gen dan enzim disebut alkaptonuria. Alkaptonurics menderita arthritis dan menghasilkan urin yang berubah hitam pada paparan udara. Mereka mengekskresikan urin dalam jumlah besar asam homogentisat setiap hari. Garrod menyarankan bahwa alkaptonuria adalah karena blok biokimia dalam proses metabolisme. Individu normal dapat memetabolisme asam homogentisat untuk produk pecahan, tetapi suatu alkaptonurics tidak bisa.
Oleh karena itu Garrod menyarankan bahwa alkaptonurics harus kekurangan enzim yang dimetabolisme oleh asam homogentisat. Garror menjelaskan penjelasan yang sama bahwa tiga kelainan hereditas manusia diklasifikasikan dalam metabolisme bawaan yang salah. Reaksi biokimia yang terkait dengan alkaptonuria dapat dilihat pada gambar 1.
Banyak reaksi biokimia lainnya yang mengalami kelainan fisiologis pada manusia yang menunjukkan hubungan antara Sindrom Lesh-Nyhan, dan Penyakit Tay Sachs. Reaksi biokimia yang terkait dengan beberapa kelainan akan ditampilkan lebih lanjut.
George W Beadle dan Edward Tatum L. yang bekerja dengan Neurospora crasa telah berhasil mengungkap hubungan yang tepat antara gen dan enzim. Berdasarkan hasil penelitian mereka pada tahun 1941, Beadledan Tatum menemukan rumus terkenal untuk menunjuk hubungan sebagai "hipotesis satu gen-satu enzim”, sebuah penemuan mereka yang menerima hadiah Nobel pada tahun 1958. Rumus menjelaskan bahwa sintesis enzim dikendalikan oleh gen. Semua diagram langkah-langkah proses kerja dari Beadle dan Tatum pada N.crasssa ditunjukkan pada Gambar 5 dan 6.
Seperti terlihat pada gambar 5, konidia N. crassa terkena mutagen seperti sinar x atau sinar ultraviolet. Berbagai mutan kemudian diisolasi setelah pemaparan. Masing-masing mutan hanya dapat berhasil untuk tumbuh pada medium minimal yang diberi suplemen nutrisi tertentu yang dibutuhkan. Disarankan setiap mutan tidak dapat mensintesis nutrisi tertentu ditambah karena reaksi biokimia yang telah diblokir. langkah penyumbatan tertentu dari reaksi biokimia yang disebabkan oleh kurangnya enzim khusus yang diperlukan karena efek dari mutasi gen mengendalikan sintesis enzim. konfirmasi proses untuk menentukan identitas dari setiap mutan diisolasi oleh Beadly dan Tatum ditunjukkan pada Gambar 6. Selanjutnya didasarkan pada semua hasil penelitian mereka, Beadle dan Tatum menyatakan hubungan antara gen dan enzim hipotesis. Model reaksi biokimia dari " hipotesis satu gen-satu enzim" ditampilkan pada gambar 7.
Contoh yang diusulkan dari model reaksi biokimia adalah reaksi biokimia yang mengarah pada sintesis arginin pada N. crassa mulai dari subtrat N-Acetylornithine seperti yang ditunjukkan pada gambar 8.
G.W. Beadle dan Boris Ephrussi juga melakukan penelitian eksperimental pada Drosophila dan Diptera lain yang menunjukkan kesimpulan yang sama seperti yang diperoleh dalam penelitian menggunakan N. crassa. Diagram penelitian eksperimental Beadle dan ephrussi ditunjukkan pada Gambar 9.
Implantasi dari larva merah (v) ditransplantasikan ke dalam larva wild type(+) akan mengembangkan mata wild type, dikarenakan difusi zat tertentu dari jaringan di sekitarnya yang mendukung pigmen wild type. Selanjutnya, impantasi dari larva merah (v) ditransplanstasikan menjadi larva cinnabar(cn) akan mengembangkan mata wid type itu diusulkan bahwa zat tertentu yang dibutuhkan dari jaringan cinnabar masuk ke dalam implan merah memproduksi mata wild type. Di sisi lain, implan dari cinnabar (cn) ditransplantasikan menjadi larva merah (v ) akan terus menerus mengembangkan mata cinnabar, karena tidak ada zat tertentu yang diperlukan dari jaringan merah (vermilion) masuk ke dalam implan cinnabar memproduksi mata wild type
Pada umumnya eksperimen transplantasi mengindikasikan bahwa pada sintesis pigmen mata penghentian proses biokimia menghasilkan pigmen mata merah terang terjadi sebelum penghentian proses biokimia yang menghasilkan pigmen mata cinnabar. Penghentian proses biokimia tersebut dapat dilihat pada gambar 10.

Hipotesis Satu Gen Satu Polipeptida
Pada tahun 1949, James V. Need dan E.A Beet secara individu mengemukakan saran mereka mengenai penyakit sickle-cell anemia. Hal tersebut disarankan bahwa kekacauan diakibatkan oleh gen mutan yang homozigot pada individu dengan sickle-cell anemia, tetapi heterozigot pada seseorang dengan pembawa sifat sickle-cell. Pada tahun yang sama, Linus Pauling dan tiga pekerjanya mengamati bahwa hemoglobin normal seseorang dan sickle-cell anemia dapat dibedakan dengan jelas dengan membedakan kebiasaan mereka pada medan elektrik. Kebiasaan dari tiga macam hemoglobin dalam proses elektroforesis ditunjukkan pada gambar 9. Seperti pada gambar 11, hemoglobin seseorang pembawa sifat keturunan terdiri dari campuran sel normal dan sickle-cell hemoglobin dalam jumlah yang hampir sama.
Hemoglobin A, bentuk paling umum dari hemoglobin pada manusia. terdiri dari empat rantai polipeptida, dua rantai α dan dua rantai identik β identik (α2β2). Pada 1057, Vernon M. Ingram menunjukkan bahwa hemoglobin sel normal dan sabit memiliki rantai α β rantai identik, tetapi berbeda pada asam amino tepatnya. Asam amino keenam rantai β dari hemoglobin normal adalah asam glutamat, sedangkan hemoglobin sel sabit adalah Valin. Jadi disimpulkan bahwa bagaimanapun gen harus menentukan urutan asam amino polipeptida.
Rantai polipeptida α dan β pada protein hemoglobin A ditentukan oleh gen yang terpisah. Banyak protein lain dan enzim (meskipun tidak semua) yang terdiri dari dua atau lebih rantai polipeptida yang dikode oleh gen yang berbeda pula. Ingram itu diusulkan bahwa hipotesis satu gen- satu enzim terbukti kurang tepat dan layak untuk diganti hipotesis satu gen-satu polipeptida (Ayala & kiger, 1984) dinyatakan lebih lanjut bahwa pada tingkat ekspresi gen mantan, setiap gen memiliki fungsi tunggal saja, yaitu kode untuk satu polipeptida.
Berdasarkan informasi tersebut mengindikasikan, jelas terlihat bahwa beberapa polipeptida yang disintesis akan berupa protein jika terdiri lebih dari satu polipeptida (satu jenis atau lebih dari satu jenis polipeptida). Sarin (1985) menjelaskan bahwa protein terdiri lebih dari satu jenis polipeptida, masing-masing polipeptida yang disintesis secara individual di bawah kendali gen yang terpisah, dan setelah sintesis setiap polipeptida akan membentuk protein akhir.
Hari ini, formula dari satu gen-satu enzim hipotesis polypeptida dilihat valid, namun berbagai penemuan lainnya telah dilaporkan. Penemuan mereka menstimulasi kita untuk kembali mengevaluasi formula hipotesis satu gen-satu polipeptida. Beberapa penemuan akan dibahas lebih lanjut.

Penemuan lain yang terkait dengan Hubungan antara gen dan sintesis polipeptida
Penemuan lainnya akan disajikan untuk memudahkan kita mengevaluasi konsistensi “hipotesis satu gen-satu polipeptida”. Penemuan mereka terbatas pada tingkat ekspresi gen, terutama sintesis polipeptida.

a. Penataan Ulang Gen
Pada saat ini diketahui DNA dari beberapa organisme eukariotik dapat menggunakan pengaturan gen yang diarahkan dalam rangka untuk mengubah keadaan ekspresi gen (Ayala&Kiger,1984). Menurut Freifelder (1985) juga, organisme eukariotik memiliki beberapa mekanisme untuk menata ulang segmen tertentu dari DNA mereka dengan cara yang terkontrol, serta memiliki mekanisme untuk menambahkan jumlah gen tertentu ketika diperlukan. Contoh DNA yang antara lain ditemukan dalam Saccharomyces cereviciae, Drosophila, Trypanosoma, serta limfosit B manusia. Hal itu bahkan mengusulkan bahwa penataan kembali urutan molekul DNA juga mungkin terlibat dalam proses peraturan selama pengembangan (Ayala & Kiger, 1984). Di sisi lain, tampaknya DNA seperti ini jarang ditemukan (Freifelder,1985).
Dalam limfosit B Manusia, seperti potensi DNA memungkinkan sel membedakan produksi berbagai imunoglobulin spesifik (Ayala & Kiger; Freifelder, 1985; Gardner, 1991). Terkait dengan penataan ulang DNA limfosit B, proses itu akan menghasilkan penataan ulang segmen gen yang mengkode untuk protein rantai ringan sebaik rantai berat immunoglobulin. Bahkan, seperti penyusunan ulang segmen gen mengambil tempat juga di limfosit T.
Penyusunan ulang gen terkait dengan ekspresi gen hingga tingkat fenotip . Di sisi lain, Menurut semua informasi yang telah dilaporkan, mengasumsikan bahwa setiap perubahan fenotipik harus diproses oleh perubahan terkait.

b. Transkrip Splicing Gen mRNA
Gen pengkode mRNA organisme eukariotik diketahui punya rangkaian penghalang, tidak seperti gen organisme prokariotik. Dalam faktanya, tRNA dan gen rRNA juga punya gen penghalang. Rangkaian penghalang itu disebut juga sebagai intron atau rangkaian yang tidak dikode, sedangkan exon sebagai rangkaian yang dikode. Gen eukariotik tersusun atas exon-exon dan juga intron-intron. Transkrip intron tidak menyusun mRNA eukariotik, hanya menyususn transkrip exon (Gardner, 1991).
Transkip ekson yang melingkar dari mRNA gen pengkode pada organisme eukariotik terjadi dengan beberapa cara. Tidak semua dari transkripsi akan selalu menjadi bagian dari mRNA. Disini ada beberapa contoh transkripsi ekson yang melingkar dari organisme eukariotik. Dua contoh fenomena ini terdeteksi pada Drosophila yang mengalami transkripsi melingkar dari gen ekson antennepedia pada yang sama baiknya dengan gen ekson trypomyosin.
Contoh lain dari fenomena ini dalah ekson splicing alternative transkripsi dari gen sapi pengkodean mRNA preprotachykinin (Klug & Cummings, 2000). Splicing alternatif transkripsi ditunjukkan pada Gambar 10. Hal ini dapat dilihat juga bahwa ada lebih dari satu jenis polipeptida yang dihasilkan dari satu molekul prekursor mRNA. Terkait dengan konteks ini, mRNA prekursor awal akan diproses menjadi dua jenis yang terpisah dari mRNA preprotachykinin. Dua jenis mRNA preprotachykinin kemudian akan diterjemahkan lalu memproduksi dua jenis protein yang disebut neuropeptida P dan K. Dua jenis neuropeptida ini adalah komponen pemancar sistem saraf sensorik disebut tachykinin, dan diyakini bahwa setiap komponen memiliki peran yang berbeda phusiologicalnya. Neuropeptida P dominan terutama dalam jaringan saraf, tetapi neuropeptida K yang lebih dominan dalam intestinum serta jaringan tiroid (Klug & Cummings, 2000).

Dapat dilihat pada gambar 10 bahwa dalam satu kasus, pengecualian dari transkripsi ekson K dari hasil pengolahan mRNA α-PPT yaitu setelah ditranslasikan hasilnya hanya neuropeptida P, tetapi tidak K. Sebaliknya, pengolahan yang meliputi keduanya (transkripsi ekson P dan K) adalah hasil dari mRNA β-PPT, yaitu hasil translasi sintesis neuropeptida P dan K.
Ekson transkrip splicing tidak termasuk transkrip intron menunjukkan dengan jelas bahwa dalam organisme eukariotik, yang colinearity antara gen dan polipeptida tidak lengkap, tidak seperti yang ditemukan dalam organisme prokariotik. Dalam kaitannya dengan colinearity lengkap seperti antara gen dan polipeptida, dikatakan bahwa konsep colinearity kaku antara gen dan polipeptida, itu adalah konsep yang kaku antara urutan nukleotida colinearity gen dan urutan asam amino dari protein dikodekan oleh gen yang terkait, umumnya tidak berlaku dalam organisme eukariotik (Sarin, 1985). Deviasi colinearity pertama-tama telah dilaporkan pada tahun 1977 oleh Chow, Gelinas, Broker, dan Roberts dari "semi pelabuhan dingin laboratorium, New York" serta dilaporkan juga oleh et al Sharp dari "Massachusetts Instite Teknologi" (Sarin, 1985 ).
Fakta terkait lebih dari satu alternatif sambungan transcript exon dari gen eukariotik yang mengkode gambaran mRNAs, indikasi jelas bahwa dalam organisme eukariotik tiap-tiap gen yang mengkode sebenarnya lebih dari satu tipe polipeptida. Dapat dikatakan bahwa sambungan transcript exon dalam organisme eukariotik didapat hasil tipe protein yang berbeda. Jadi, expresi dari gen dapat melepaskan sebuah kelompok relatif protein.
c. Gen yang Overlapping (Tumpang Tindih)
Dewasa ini sudah diketahui ada gen tertentu pada gen lain. Fenomena ini disebut gen yang overlapping (Tamarin, 1991; Turner et al, 1997;. Klug murah Cummings, 2000; Lewin, 2000). Pertama dari semua fenomena gen yang tumpang tindih terdeteksi pada fag Φx174. Fag ini memiliki DNA untai tunggal kromosom 5386 nukleotida. Ini adalah benar bahwa kode DNA hanya 1795 asam amino yang cukup untuk menyusun 5-6 protein. Namun hal ini justru fag kecil mampu sintesis protein terdiri dari 11 lebih dari 2300 asam amino. Studi banding pada urutan nukleotida DNA fag serta pada urutan asam amino dari polipeptida disintesis kemudian berhasil menemukan setidaknya empat kasus inisiasi beberapa bukti gen yang tumpang tindih (Klug murah Cummings, 2000). Posisi relatif dari coding urutan tujuh polipeptida dalam fag Φx174 akan ditampilkan pada Gambar 11.

B
A A’ C D
K E

Gambar 11
Penggambaran dari 7 sekuen pengkode pada phage x174
(Klugs dan Cummings, 2000)

Ada tujuh gen yang saling tumpang tindih (A, A ', C, D, E, B, dan K) digambarkan pada Gambar 11, dan terlihat juga bahwa urutan pengkodean K dan polipeptida B dimulai pada pembacaan bingkai yang berbeda, meskipun dua urutan pengkodean juga dalam urutan pengkodean polipeptida A. Bahkan sekuens K yang saling tumpang tindih juga menjadi bagian dari urutan pengkodean yang menentukan C polipeptida. Sekuen A' adalah benar-benar dalam sekuen A bahkan dua sekuen terakhir berada pada nukleotida yang sama, namun sekuen E dimulai dalam menentukan urutan D polipeptida.
Terkait dengan gen yang tumpang tindih, ada dua versi cara membaca bingkai gen. Gen yang tumpang tindih memungkinkan memiliki cara pembacaan yang sama, serta pembacaan yang berbeda. Ilustrasi pembacaan yang berbeda dari dua mRNA yang overlapping, akan ditunjukkan pada gambar 12.
Dalam hubungannya dengan bingkai pembacaan gen-gen yang overlapping, menurut Lewin (2000) ada dua versi, seperti yang telah disarankan. Versi pertama, gen yang memiliki kesamaan dalam satu bingkai pembacaan, tetapi versi kedua mencakup gen yang memiliki bingkai pembacaan yang berbeda.
Saat ini, tumpang tindih gen terbentuk juga dalam fag GH, SV40 X, dan pada bakteri seperti E. coli, serta dalam kromosom mitokondria (Tamarin, 1991; Turner et al, 1997; Klug & Cummings, 2000; Lewin, 2000). Gen-gen yang tumpang tindih dilaporkan dalam E.coli mengkode ampC untuk polipeptida β lactemase dan frdC untuk polipeptida fumarat reduktase. Gen ampC dimulai pada bagian dari gen pengkodean untuk kode frdC terakhir genetik. Dalam konteks ini, terminator frdC mungkin memiliki peran regulasi transkripsi gen pada ampC (Tamarin, 1991).
Gen-gen yang overlapping juga terdeteksi pada tikus dengan syarat terjadinya gen overlapping tidak mutlak sama seperti kejadian yang dilaporkan. Ada dua gen yang overlapping pada tikus yang ditemukan dalam DNA yang berlawanan di daerah yang sama (Tamarin, 1991). Pada tikus, gen yang overlapping disebut GnRH (gonadothropin-releasing hormone) dan RH yang menentukan protein yang belum diketahui fungsinya diekspresikan dalam jantung.
Berdasarkan laporan peristiwa overlapping gen-gen, itu menunjukkan bahwa gen-gen tersebut terjadi secara khusus pada virus,bakteri, dan yang mempunyai genom kecil lainnya. Jadi,ini sebuah nasihat logis bahwa gen overlapping akan mengoptimiskan fage DNA yang berukuran kecil (Turner et al, 1997; Klug & Cummings, 2000). Disisi lain, ini juga menunjukkan bahwa peristiwa gen-gen overlapping mempunyai resiko bagi mereka sendiri. Beberapa mutasi gen bisa mengubah lebih dari satu polipeptida.

d. Tidak Setiap Gen Mentranskripsi mRNA
Saat ini sudah banyak diketahui bahwa tidak setiap gen mentranskripsi mRNA yang akan ditranslasikan untuk membentuk polipeptida. Telah diketahui bahwa beberapa gen mentranskripsi tRNA, rRNA sebaik snRNA. RNA – RNA tersebut tidak ditranslasikan untuk memproduksi banyak polipeptida, meskipun terlibat secara langsung dalam sintesis polipeptida.
Ada banyak gen yang terdeteksi di berbagai organisme, berfungsi untuk menstrankripsi banyak jenis tRNA yang berpasangan dengan kode genetika yang berhubungan dengan proses translasi. Di perkirakan bahwa ada 60-63 jenis kode genetik (Lewin, 2000).
Ada juga beberapa gen terdeteksi dalam berbagai organisme yang berfungsi untuk menuliskan rRNA meskipun kuantitasnya tidak begitu banyak seperti kuantitas gen tRNA. Sebagai contoh dalam organisme prokariotik, ada gen yang terpisah menuliskan rRNA 5S, 16S rRNA, serta 23S rRNA, tetapi dalam mamalia ada juga gen lain menuliskan rRNA 5S, 5.8S rRNA, 18S rRNA, 28S rRNA dan. Di sisi lain, pada organisme eukariotik ada juga beberapa gen menuliskan snRNA.

Review Of One Gen One Polypeptida Hypothesis
Berdasarkan keterangan yang berhubungan antara “hipotesis satu gen-satu enzim” maupun “hipotesis satu gen satu polipeptida” yang didiskusikan sebelumnya, sangat jelas bahwa dua paradigma dirumuskan di era dimana gen diinterpretasikan sebagai sekuen/rangkaian DNA berlanjut. Di sisi lain, interpretasi gen sekarang menjadi bahan debatan. Tijauan dari hipotesis satu gen satu polipeptida akan dilaksanakan dengan batasan dua dimensi.
Berhubungan dengan interpretasi gen sebagai sekuen DNA yang berlanjut, fakta penataan ulang gen dibahas, meskipun kenyataan yang dilaporkan terbatas, sebenarnya menunjukkan bahwa satu gen dapat menentukan lebih dari satu polipeptida. Dalam hubungan ini, ada saran bahwa konsep klasik satu gen-satu polipeptida hipotesis tidak memadai, setidaknya dalam bentuk yang paling sederhana untuk menjelaskan hubungan gen-antibodi (Gardner, 1991). Di sisi lain, dalam batas-batas penafsiran gen bukan sebagai urutan DNA berlanjut, fakta penataan ulang gen dibahas sebenarnya tidak perlu ditafsirkan lagi bahwa salah satu gen dapat menentukan lebih dari satu polipeptida. Dalam batas-batas konteks itu belum ditafsirkan bahwa lebih dari satu gen menentukan lebih dari satu jenis polipeptida, sehingga paradigma hipotesis satu gen-satu polipeptida belum tergantikan.
Colinearity antara gen dan polipeptida dalam organisme eukariotik seperti yang dibahas adalah tentang dalam batas-batas penafsiran gen sebagai urutan DNA yang berlanjut dan tidak relevan membicarakan mengenai batas-batas penafsiran gen bukan sebagai urutan DNA berlanjut. Oleh karena itu dalam organisme eukariotik, colinearity tidak mutlak karena transkrip intron dari mRNA coding gen tidak menjadi bagian dari kode genetik yang akan menerjemahkan serta menghasilkan polipeptida. Oleh karena itu, dalam organisme eukariotik, tidak semua bagian dari gen mRNA coding bertanggung jawab untuk biosintesis polipeptida. Demikian, satu gen-satu polipeptida hipotesis tidak cukup untuk organisme eukariotik
Adanya lebih dari satu alternatif penyambungan ekson transkrip mRNA gen dalam organisme eukariotik merupakan suatu bukti secara langsung dan eksplisit bahwa salah satu kode gen mRNA dapat menentukan lebih dari satu jenis polipeptida. Dengan demikian, pada kenyataannya, ini adalah bukti yang sangat kuat bahwa satu gen-satu polipeptida, menunjukkan suatu hipotesis yang valid untuk organisme eukariotik. Kesimpulan tersebut relevan hanya dalam batas-batas penafsiran gen sebagai urutan DNA berlanjut.
Benar bahwa secara struktur jika penataan ulang gen disregulasi (gen dapat ditafsirkan bukan sebagai urutan DNA berlanjut), maka setiap pengulangan yang dikategorikan secara tepat belum menentukan jenis polipeptida. Di sisi lain, jika gen ditafsirkan sebagai urutan DNA berlanjut, adanya penataan ulang gen juga meletakkan validitas hipotesis satu gen-satu polipeptida setidaknya dalam organisme yang telah dilaporkan memiliki gen tersebut.
Karena hanya di mRNA akan diterjemahkan untuk diproduksi mengingat tRNA, rRNA, dan juga snRNA, sehingga hipotesis tentang satu per satu model gen polipeptida seperti gen tRNA, rRNA, juga snRNA akan diacuhkan. RNA lainnya akan diacuhkan kecuali mRNA yang berlaku pada dua gen terjemahan. Hal ini sangat beralasan bahwa model dua gen yang diterjemahkan yang keluar batas dikatakan tidak benar
Berdasarkan semua fakta yang telah didiskusikan dapat diambil kesimpulan bahwa paradigma hipotesis satu gen merupakan satu polipeptida tidat cocok pada semua organisme dari virus dan juga organisme eukariotik yang lebih tinggi. Namun, apabila ingin mempertahankan paradigm tersebut, tentunya paradigma tersebut hanya berlaku pada virus-virus tertentu seperti oragnisme prokariotik, dengan catatan bahwa penerjemahan gen harus diperbaiki sebelumnya, sehingga penyusunan kembali gen dapat diabaikan.
Dalam kaitannya dengan fakta penataan ulang gen serta fakta lebih dari satu dari transkrip ekson alternatif dalam organisme eukariotik, Lewin (2000) menyatakan bahwa "bukannya mengatakan" satu gen satu polipeptida “ kita (juga) dapat menggambarkan sebagai hubungan " satu polipeptida satu gen ". Terkait dengan usulan Lewin (2000), sekilas tampaknya seperti paradigma alternatif yang memadai pengganti paradigma hypothesis satu gen satu-polypeptida, karena paradigma baru tidak terbatas dalam batas-batas dari dua interpretasi gen. Di sisi yang lain, jika itu dianalisis ebih hati-hati, paradigma baru dari satu gen satu polipeptida belum bertentangan fakta (yang terjadi) dalam organisme eukariotik, satu polipeptida tidak ditentukan oleh semua bagian gen. Paradigma baru ini belum juga bertentangan untuk fakta lain bahwa tidak semua RNA gen akan diterjemahkan untuk menghasilkan polipeptida.
Akhirnya hanya ada beberapa catatan tambahan yang menyebutkan bahwa jika kebenaran "satu gen-satu polipeptida" tidak diperhatikan dalam semua organisme, maka paradigma terkenal dari genetika molekuler harus diubah. Bagaimanakah paradigma selanjutnya di masa depan? Paradigma berikutnya akan dibahas lebih lanjut jika diperlukan, tapi sangat penting untuk dicatat meskipun paradigma tersebut belum diperlukan. Di sisi lain, tidak ada keraguan hubungan antara gen dan polipeptida, tanpa merumuskan secara jelas hubungan antara satu gen dan satu polipeptida.